La Sociedad Mexicana de Proteómica fue fundada el 1ro de Junio del 2005. Sus objetivos fundamentales:
a) Promover y divulgar la investigación proteómica en México,
b) Colaborar en la formación de recursos humanos altamente calificados,
c) Mantener un foro abierto para la resolución de problemas tecnológicos comunes
d) Permanecer a la vanguardia de la información científica en esta área.

Primera Mesa Directiva de la SMP (2005-2007) son:
Presidente: Cesar Batista IBT-UNAM
Vice-presidente: Sergio Encarnación CCG-UNAM
Tesorero: Fernando Zamudio IBT-UNAM
Secretaria: Victoria Pando IBT-UNAM
Vocales:
Sandra Contreras CCG-UNAM
Alicia Chagolla CINVESTAV-Irapuato
Gabriel Del Rio Guerra - IFC UNAM Ms.
Magdalena Hernández CCG-UNAM

Mesa Directiva (2008-2009))
Presidente: Luis M. Terán, INER
Vicepresidente: Humberto Lanz Mendoza, INSP
Secretaria: Ana Paulina Barba de la Rosa, IPICyT
Tesorero: Gerardo Corzo, IBT
Vocales:
José Luis Gallegos Pérez, Inmegen
Bronwyn Jane Barkla, IBT
Luis González de la Vara, Cinvestav
Roberto Arreguín Espinosa, Instituto de Química, UNAM